为解决染色质接触检测及数据分析问题,研究人员开展 cohesin HiChIP 实验研究,优化了实验方案及分析流程,意义重大。 染色质构象研究的新突破:改良的 cohesin HiChIP 技术 在微观的细胞世界里,基因组的折叠与包装是一项极其精妙的 “工程”。大约两米长的 ...
在研究过程中,研究人员主要运用了染色质免疫沉淀测序(ChIP - seq)技术,通过对黏连蛋白(cohesin)等蛋白的 ChIP - seq 分析,探索其在基因组上的分布特征;同时结合了蛋白质相互作用研究技术,如免疫共沉淀等,探究 cohesin 与其他蛋白的相互作用关系 ...
▎药明康德内容团队编辑(来源:上海交通大学)在真核细胞中,大约两米长的基因组DNA被巧妙地分层包装,形成了从染色体区室到拓扑相关结构域再到染色质环的多层次高阶染色质结构,以适应微小的细胞核。CTCF(CCCTC结合因子)与粘连蛋白通过“环挤出”的方式在细胞间期形成多层次的高维染色质结构,在基因表达调控、染色质三 ...
▎药明康德内容团队编辑(来源:中国科学院自动化研究所)人类大脑皮层在功能和结构上表现出空间异质性,其形成过程受到遗传因素和神经连接模式的共同调控。遗传因素通过调控神经发育过程中信号分子和转录因子的梯度,推动皮层区域分化。同时,皮层不同区域之间的连接模 ...
TADs一般覆盖千到百万碱基的染色质区域,其内部具有较强的相互作用,而边界区域则常富集有cohesin和CTCF等蛋白。TAD边界具有绝缘作用,能够阻隔不同TAD之间的相互作用,即能有效阻断异常的增强子-启动子接触,从而维持正常的基因表达调控。因此,TAD形成机制 ...
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