今天我们来看看如何做GSEA（Gene Set Enrichment Analysis，基因集富集分析）以及GSEA的结果如何解读。 首先我们需要了解一下GSEA跟传统的 基因富集分析 有什么区别，有什么优势。我相信大家在做传统的基因功能富集分析的时候肯定遇到这样的情况，一条富集到的通路 ...

GSEA是Gene Set Enrich Analysis，翻译过来是基因集的富集分析。 首先明确，富集分析就是通过数据库存储的知识，搞清楚一个基因集合功能的过程。 在数据库中，提前设计好了很多描述功能的标签（比如GO或KEGG），然后把这样标签贴给每一个基因。

GSEA富集分析 - 界面操作 （若图片显示不清，请跳转我的博客） GSEA定义. Gene Set Enrichment Analysis (基因集富集分析)用来评估一个预先定义的基因集的基因在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势，从而判断其对表型的贡献。

gsea（基因集富集分析）是一种用于评估基因集在基因表达数据中的富集程度的方法，判断这些基因集对特定表型的贡献程度。 GSEA的用途 生物学研究： 帮助理解基因如何在特定条件下调控特定的生物学过程，如癌症发生、免疫、代谢等。

在gsea分析中，通常需要的是一组基因的表达数据，这些数据可以是来自实验组的，也可以是来自对照组的，或者是两者的混合。 重要的是要确保基因表达数据能够反映预期的生物学状态，而不一定需要对照组来提供基准或参照。

单细胞测序中GO、KEGG、GSEA分析是三种常用的高级分析方法，它们各有特点和应用场景，以下是它们的主要区别： GO分析. 1.定义与目的：Gene Ontology（GO）是一个国际标准化的基因功能分类系统，旨在对基因和蛋白质的功能进行限定和描述。其目的是通过标准化的 ...

es是 富集分数 ，可列可不列，但es是应关注的重要指标，当es值大于0时，表示某一 功能基因 富集在排序序列的前端，若为小于0时，则某一功能基因富集在排序序列的后端，这说明这些基因的表达谱数据对你所定义的分组的差异有显著影响，从而找到我们关注的 ...

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2024年4月17日 · gsea方法旨在确定一个预先定义的基因集是否在两个生物学状态（例如实验组和对照组）中显示出显著的一致性差异。 然而，GSEA的分析并不依赖于对照组的存在，因为它关注的是基因表达模式的一致性，而不是组间的差异。

2021年9月12日 · 可以从文献中找到线粒体自噬相关的基因集，也可以从各大数据库中找到相应的基因集，然后用博德研究所的gsea软件进行富集计算即可。 如果富集，则证明是GSEA结果为线粒体自噬相关的途径。